部分容积效应 体素不连续地显示一个物体，使物体中的细节被平均分配，即体素内的细节由一个加权平均值表达,这种现象被称为部分容积效应(partial volume effect),是CT成像中常见的图像伪影,使密度差别较大的物体边缘变模糊。层厚越大,部分容积效应就越严重。
插值 插值或内插（interpolation）是采用数学方法在一抑制函数的两端数值，估计该函数在两端之间任一值的方法
心电门控的应用价值影像检查中，由于组织或脏器的运动（例如呼吸、心跳等）容易使得影像设备（包括超声、线CT以及MRI等）产生伪影，这会降低图像的分辨率及诊断价值。因而在心1血管和呼吸疾病研究中，控制好由于心脏或隔膜的运动而对 Micro CT 图像产生的影响，是至关重要的。
为了获得更好质量的影像，一般运用诸如呼吸补偿和呼吸门控、心电门控和心电触发等技术来做影像修正。所谓心电门控就是为了减少或消除心腔及心脏大血管的搏动对图像造成的影响而采取的基于硬件的门控技术手段。
骨骼：骨骼是Micro-CT 主要的应用领域之一，其中骨小梁又是主要研究对象，骨松质和青皮质的变化与骨质疏松、骨折、局部缺血和遗传疾病等病症有关。目前， Micro-CT技术在很大程度上取代了破坏性的组织形态计学方法。
牙齿及牙周组织：能够从3D整体结构出发，对管根形态改变、龋1齿破坏、牙组织密度变化、牙槽骨结梅和力学特性的变化等情况进行研究。
生物材料：例如，分析体外制备仿生材料支架的孔隙率、强度等参数，优化支架设计;扫描需要换的组织样晶，获取三维图像后输出为STL文件进行快速成形 (CAD/CAM) ，等等。
小动物CT比普通射线检查的密度分辨率高的多，但是仍有某些病变在CT上呈等密度改变，有必要借助于造影剂增强对病变的观察。
造影剂是一种为增强影像观察效果而注入(或服用)到生物体组织或的化学制品，为获得CT更高的成像需求应运而生。这些制品的密度高于（阳性造影剂）或低于（阴性造影剂）周围组织， 形成的对比可用CT显示图像。
